การแทนข้อมูลเครือข่ายด้วย pandas

การวิเคราะห์เครือข่ายระดับกลางใน Python

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

ไฟล์ CSV สำหรับจัดเก็บข้อมูลเครือข่าย

ไฟล์ CSV

person,party,weight
Barrett.Samuel,LondonEnemies,1
Barrett.Samuel,StAndrewsLodge,1
Marshall.Thomas,LondonEnemies,1
Eaton.Joseph,TeaParty,1
Bass.Henry,LondonEnemies,1

ไฟล์ CSV สำหรับจัดเก็บข้อมูลเครือข่าย

ข้อดี:
- อ่านได้ง่าย
- วิเคราะห์เพิ่มเติมด้วย pandas ได้
ข้อเสีย:
- ข้อมูลซ้ำ เปลืองพื้นที่ดิสก์
ใช้ DataFrame 2 ชุด: รายการโหนดและรายการเอดจ์

รายการโหนดและรายการเอดจ์

รายการโหนด
- แต่ละแถวคือโหนดหนึ่งโหนด
- คอลัมน์แทนข้อมูล metadata ของโหนดนั้น
รายการเอดจ์
- แต่ละแถวคือเอดจ์หนึ่งเอดจ์
- คอลัมน์แทนข้อมูล metadata ของเอดจ์นั้น

pandas และกราฟ

list(G.nodes(data=True))

[(0, {'bipartite': 0}),
(1, {'bipartite': 0}),
(2, {'bipartite': 0}),
...]

nodelist = []

for n, d in G.nodes(data=True):
    node_data = dict() 
    node_data['node'] = n

    node_data.update(d)

    nodelist.append(node_data)

pandas และกราฟ

nodelist

[{'bipartite': 0, 'node': 0},
{'bipartite': 0, 'node': 1},
{'bipartite': 0, 'node': 2},
{'bipartite': 0, 'node': 3},
{'bipartite': 0, 'node': 4},...]

pandas และกราฟ

import pandas as pd
pd.DataFrame(nodelist)

  bipartite  node
0           0     0
1           0     1
2           0     2
3           0     3
4           0     4
5           1     5
6           1     6
7           1     7

pd.DataFrame(nodelist).to_csv('my_file.csv')

มาฝึกกันเถอะ!

การวิเคราะห์เครือข่ายระดับกลางใน Python