Подання мережевих даних у pandas

Середній рівень Network Analysis у Python

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

CSV-файли для зберігання мережевих даних

  • Файл CSV
person,party,weight
Barrett.Samuel,LondonEnemies,1
Barrett.Samuel,StAndrewsLodge,1
Marshall.Thomas,LondonEnemies,1
Eaton.Joseph,TeaParty,1
Bass.Henry,LondonEnemies,1
Середній рівень Network Analysis у Python

CSV-файли для зберігання мережевих даних

  • Переваги:
    • Зрозумілий для людини
    • Можна далі аналізувати в pandas
  • Недоліки:
    • Повторення; місце на диску
  • Два DataFrame: список вузлів і список ребер
Середній рівень Network Analysis у Python

Список вузлів і список ребер

  • Список вузлів
    • Кожний рядок — один вузол
    • Стовпці — це метадані, прив'язані до вузла
  • Список ребер
    • Кожний рядок — одне ребро
    • Стовпці — це метадані, прив'язані до ребра
Середній рівень Network Analysis у Python

pandas і графи

list(G.nodes(data=True))

[(0, {'bipartite': 0}),
(1, {'bipartite': 0}),
(2, {'bipartite': 0}),
...]

nodelist = []

for n, d in G.nodes(data=True):
    node_data = dict() 
    node_data['node'] = n

    node_data.update(d)

    nodelist.append(node_data)
Середній рівень Network Analysis у Python

pandas і графи

nodelist

[{'bipartite': 0, 'node': 0},
{'bipartite': 0, 'node': 1},
{'bipartite': 0, 'node': 2},
{'bipartite': 0, 'node': 3},
{'bipartite': 0, 'node': 4},...]
Середній рівень Network Analysis у Python

pandas і графи

import pandas as pd
pd.DataFrame(nodelist)

  bipartite  node
0           0     0
1           0     1
2           0     2
3           0     3
4           0     4
5           1     5
6           1     6
7           1     7

pd.DataFrame(nodelist).to_csv('my_file.csv')
Середній рівень Network Analysis у Python

Давайте потренуємось!

Середній рівень Network Analysis у Python

Preparing Video For Download...