Referenser vs. kopior

Skalbar databehandling i R

Simon Urbanek

Member of R-Core, Lead Inventive Scientist, AT&T Labs Research

Stora matriser och matriser – likheter

Delmängd
Tilldela

Stora matriser och matriser – skillnader

big.matrix lagras på disk
Består mellan R-sessioner
Kan delas mellan R-sessioner

R skapar vanligtvis kopior vid tilldelning

Detta skapar en kopia av a och tilldelar den till b.

a <- 42
b <- a
a

a <- 43
a

R skapar vanligtvis kopior vid tilldelning

a <- 42

foo <- function(a){a <- 43 
                   paste("Inside the function a is", a)}

foo(a)

"Inside the function a is 43"

paste("Outside the function a is still", a)

"Outside the function a is still 42"

Inte alla R-objekt kopieras

Den här funktionen ändrar faktiskt värdet på a i den globala miljön

foo <- function(a) {a$val <- 43 
                    paste("Inside the function a is", a$val)}
a <- environment()
a$val <- 42
foo(a)

"Inside the function a is 43"

paste("Outside the function a$val is", a$val)

"Outside the function a$val is 43"

`deepcopy()`

# x is a big matrix
x <- big.matrix(...)

# x_no_copy and x refer to the same object
x_no_copy <- x

# x_copy and x refer to different objects
x_copy <- deepcopy(x)

Referensbeteende

R skapar inte kopior implicit

Minimerar minnesanvändning
Minskar körtid

Inte alla R-objekt kopieras

library(bigmemory)

x <- big.matrix(nrow = 1, ncol = 3, type = "double", 
                init = 0, 
                backingfile = "hello-bigmemory.bin", 
                descriptorfile = "hello-bigmemory.desc")

Inte alla R-objekt kopieras

x_no_copy <- x
x[,]

0 0 0

x_no_copy[,]

0 0 0

x[,] <- 1
x[,]

1 1 1

x_no_copy[,]

1 1 1

Inte alla R-objekt kopieras

x_copy <- deepcopy(x)
x[,]

1 1 1

x_copy[,]

1 1 1

x[,] <- 2
x[,]

2 2 2

x_copy[,]

1 1 1

Nu kör vi en övning!

Skalbar databehandling i R