Välkommen till kursen

Att sammanfoga data med data.table i R

Scott Ritchie

Postdoctoral Researcher in Systems Genomics

Sammanfoga data.tables

Kombinera information från två data.tables till en enda data.table

Kursöversikt

Kapitel 1: Sammanfoga data med merge()
Kapitel 2: Joins i data.table-arbetsflödet
Kapitel 3: Felsökning av joins
Kapitel 4: Konkatenera och omforma data.tables

Tabellnycklar

Kolumner som kopplar samman information mellan två tabeller

library(data.table)

demographics <- data.table(name   = c("Trey", "Matthew", "Angela"), 
                           gender = c(NA, "M", "F"), 
                           age    = c(54, 43, 39))

shipping <- data.table(name    = c("Matthew", "Trey", "Angela"), 
                       address = c("7 Mill road", "12 High street", 
                                   "33 Pacific boulevard"))

Inspektera `data.table`s i din R-session

Funktionen tables() visar alla data.tables som är inlästa i din R-session

tables()

           NAME NROW NCOL MB            COLS KEY
1: demographics    3    3  0 name,gender,age    
2:     shipping    3    2  0    name,address    
Total: 0MB

Inspektera `data.table`s i din R-session

Funktionen str() visar typen för varje kolumn i en enskild data.table

str(demographics)

Classes 'data.table' and 'data.frame':    3 obs. of  3 variables:
 $ name  : chr  "Trey" "Matthew" "Angela"
 $ gender: chr  NA "M" "F"
 $ age   : num  54 43 39
 - attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr>

Inspektera `data.table`s i din R-session

demographics_all

         name sex age
  1:     Trey  NA  54
  2:  Matthew   M  43
  3:   Angela   F  39
  4: Michelle   F  63
  5:  Mohamed   M  26
 ---                 
102:  Patrick   M  27
103:      Wei   F  41
104:     Adam   M  33
105:  Somchai   M  53
106:     Alma   F  19

Nu kör vi en övning!

Att sammanfoga data med data.table i R