Sätta och visa nycklar i data.table
Att sammanfoga data med data.table i R
Scott Ritchie
Postdoctoral Researcher in Systems Genomics
Sätta nycklar i `data.table`
Med nycklar behöver du inte använda on-argumentet vid join-operationer
- Praktiskt när en
data.tableanvänds i många olika join-operationer
Sorterar data.table i minnet efter nyckelkolumn(erna)
- Gör filtrering och join-operationer snabbare
Flera kolumner kan anges som nycklar
Funktionen `setkey()`
Nyckelkolumner skickas som argument
setkey(DT, ...)
setkey(DT, key1, key2, key3)setkey(DT, "key1", "key2", "key3")
# To set all columns in DT as keys
setkey(DT)
Funktionen `setkey()`
Sätt nycklar i båda data.tables innan en join
setkey(dt1, dt1_key)
setkey(dt2, dt2_key)
Utför en inner-, höger- och vänsterjoin:
# Inner join dt1 and dt2 dt1[dt2, nomatch = 0]# Right join dt1 and dt2 dt1[dt2]# Left join dt1 and dt2 dt2[dt1]
Sätta nycklar programmatiskt
Nyckelkolumner anges som en teckensträng-vektor
keys <- c("key1", "key2", "key3")
setkeyv(dt, keys)
Hämta nycklar
haskey() kontrollerar om nycklar är satta
haskey(dt1)
TRUE
key() returnerar de nyckelkolumner som är satta
key(dt1)
"dt1_key"
Hämta nycklar
När inga nycklar är satta
haskey(dt_no_key)
FALSE
key(dt_no_key)
NULL
Visa alla `data.table`s och deras nycklar
tables()
NAME NROW NCOL MB COLS KEY
[1,] dt 3 4 1 key1,key2,key3,value key1,key2,key3
[2,] dt1 1,000 3 1 dt1_key_column,value,group dt1_key
[3,] dt2 1,000 2 1 dt2_key_column,time dt2_key
[4,] dt_no_key 5 2 1 id,color
Total: 4MB
Nu kör vi en övning!
Att sammanfoga data med data.table i R
