Ağ görselleştirme

Python ile Ağ Analizine Giriş

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

Mantıksız vs. mantıklı görselleştirmeler

Büyük grafiklerin iki gösterimi. Her iki durumda da yapı saç yumağı gibi dağınık, yorumlamak zor.

Ağları görselleştirme

Matris grafikler
Yay grafikler
Circos grafikler

Ağları görselleştirme

Matris grafikler
Yay grafikler
Circos grafikler

Matris grafik

3x3 bir matris; sütun adları A, B, C; satır adları da A, B, C. İlgili düğümler bağlıysa hücreler siyah. Yanında A, B, C düğümlü bir grafik; A-B ve A-C bağlı, B-C doğrudan bağlı değil.

Matris grafik

Aynı matris ve grafik, ancak matrisin köşegeni gri renkte.

Matris grafik

Aynı matris ve grafik, ancak (A, B) ve (B, A) hücreleri sarı. Grafikteki A-B kenarı da sarı.

Matris grafik

Aynı matris ve grafik, ancak (A, C) ve (C, A) hücreleri sarı. Grafikteki A-C kenarı da sarı.

Yönlü matrisler

ch1-3.012.png

Ağları görselleştirme

Matris grafikler
Yay grafikler
Circos grafikler

Yay grafik

Üçer düğümlü iki grafik. İkisinde de A, B, C düğümleri var; A-B ve A-C kenarları mevcut. İlkinde düğümler çizgide ve kenarlar eğri; ikincisinde düğümler düzende ve kenarlar düz.

Ağları görselleştirme

Matris grafikler
Yay grafikler
Circos grafikler

Circos grafik

ch1-3.018.png

Circos grafik

Altı düğümlü iki grafik. Solda düğümler dairede, kenarlar yay şeklinde. Sağda düğümler rastgele, kenarlar düz çizgi.

nxviz API

import nxviz as nv
import matplotlib.pyplot as plt

ap = nv.arc(G)

plt.show()

Hadi pratik yapalım!

Python ile Ağ Analizine Giriş