Sayı normalizasyonu

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

iş akışı - normalizasyon

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Sayı normalizasyonu

normalizasyon yöntemleri

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Kütüphane derinliği normalizasyonu

normalizasyon yöntemleri

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

normalizasyon yöntemleri

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Kütüphane bileşimi etkisi

RNA bileşimi - normalizasyon

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

DESeq2 normalizasyonu

oranların medyanı örneği

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Normalize sayımlar: hesaplama

dds_wt <- estimateSizeFactors(dds_wt)

sizeFactors(dds_wt)

boyut faktörleri

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Normalize sayımlar: çıkarma

normalized_wt_counts <- counts(dds_wt, normalized=TRUE)

View(normalized_wt_counts)

normalize_sayimlar

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Hadi pratik yapalım!

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Preparing Video For Download...