Farklı ifade analizi

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Mary Piper

Bioinformatics Consultant and Trainer

DESeq2

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Farklı ifade analizi: DESeq2 kılavuzu

vignette(DESeq2)

DESeq2 vignette

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

kılavuzu keşfetme

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

DESeq2 iş akışı

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

DESeq2 için verileri içe aktarma

# Read in raw counts
wt_rawcounts <- read.csv("fibrosis_wt_rawcounts.csv") 
View(wt_rawcounts)

fibrosis wt sayımları

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

DESeq2 için verileri içe aktarma: metadata

# Read in metadata
wt_metadata <- read.csv("fibrosis_wt_metadata_unordered.csv") 
View(wt_metadata)

fibrosis wt metadata

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Hadi pratik yapalım!

R ile Bioconductor kullanarak RNA-Seq

Preparing Video For Download...