Pruebas de hipótesis

Casos prácticos de pensamiento estadístico

Justin Bois

Lecturer, Caltech

Efectos de la mutación en la actividad

1 Datos cortesía de Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou y David Prober, Caltech
Casos prácticos de pensamiento estadístico

Definiciones de genotipo

  • Silvestre: Sin mutaciones

  • Heterocigoto: Mutación en uno de los dos cromosomas

  • Mutante: Mutación en ambos cromosomas
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Efectos de la mutación en la actividad

1 Datos cortesía de Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou y David Prober, Caltech
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Efectos de la mutación en la actividad

1 Datos cortesía de Avni Gandhi, Grigogios Oikonomou y David Prober, Caltech
Casos prácticos de pensamiento estadístico

Prueba de hipótesis

Evaluación de cuán razonables son los datos observados asumiendo que una hipótesis es verdadera

Casos prácticos de pensamiento estadístico

p-valor

La probabilidad de obtener un valor de tu estadístico de prueba al menos tan extremo como el observado, asumiendo que la hipótesis nula es verdadera

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Estadístico de prueba

  • Un único número que puede calcularse con los datos observados y con datos simulados bajo la hipótesis nula

  • Sirve como base de comparación
Casos prácticos de pensamiento estadístico

p-valor

La probabilidad de obtener un valor de tu estadístico de prueba al menos tan extremo como el observado, asumiendo que la hipótesis nula es verdadera

Requiere especificar claramente:

  • Hipótesis nula que pueda simularse
  • Estadístico de prueba calculable con datos observados y simulados
  • Definición de al menos tan extremo como
Casos prácticos de pensamiento estadístico

Flujo de trabajo para contrastes de hipótesis

  • Expón claramente la hipótesis nula
  • Define tu estadístico de prueba
  • Genera muchos conjuntos de datos simulados asumiendo que la hipótesis nula es verdadera
  • Calcula el estadístico de prueba para cada conjunto simulado
  • El p-valor es la fracción de conjuntos simulados cuyo estadístico es al menos tan extremo como el de los datos reales
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Especificar la prueba

Hipótesis nula: las longitudes de episodios activos de peces silvestres y heterocigotos tienen la misma distribución

Estadístico de prueba: diferencia en la media de la longitud del episodio activo entre heterocigotos y silvestres

Al menos tan extremo como: el estadístico de prueba es mayor o igual que lo observado

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Prueba de permutación

Para cada réplica:

  • Baraja las etiquetas de los datos
  • Calcula el estadístico de prueba
perm_reps = dcst.draw_perm_reps(
    data_a, data_b, dcst.diff_of_means, size=10000
)

El p-valor es la fracción de réplicas al menos tan extremas como lo observado

p_val = np.sum(perm_reps >= diff_means_obs) / len(perm_reps)
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¡Vamos a practicar!

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