The Bioconductor Project

R 中的 Bioconductor 入門

James Chapman

Curriculum Manager, DataCamp

Bioconductor

Bioconductor

1 Bioconductor (www.bioconductor.org)
R 中的 Bioconductor 入門

我們量測什麼，為什麼？

  • 結構：元素、區域、大小、順序、關係

structure-parts

  • 功能：表現、層級、調控、表型

function

R 中的 Bioconductor 入門

如何安裝 Bioconductor 套件？

  • Bioconductor 有自己的套件庫與安裝方式
# Install BiocManager
install.packages("BiocManager")

# Install the GenomicRanges package
BiocManager::install("GenomicRanges")
R 中的 Bioconductor 入門

Bioconductor 與套件版本

# Load BiocManager
library(BiocManager)


# Check Bioconductor version
version()
R 中的 Bioconductor 入門

檢查套件版本

# Load GenomicRanges
library(GenomicRanges)


# Check versions for reproducibility
sessionInfo()
R 中的 Bioconductor 入門

套件更新

# Check for package updates
valid()
R 中的 Bioconductor 入門

一起來練習吧！

R 中的 Bioconductor 入門

Preparing Video For Download...