繪製 Poisson 迴歸

R 的廣義線性模型

Richard Erickson

Instructor

何時在 Poisson 中使用 geom_smooth

最適合連續自變數
例如：劑量增加與每 cm$^2$ 的癌細胞數
否則改用 boxplot 或類似圖形工具

癌細胞劑量研究

模擬資料
劑量反應
- x：Dose
- y：每 cm$^2$ 的癌細胞數

繪製散點

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
    geom_point()

含散點的 ggplot

抖動散點

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)

ggplot2 抖動散點示例。

geom_smooth()

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)
   geom_smooth()

在抖動散點上疊加預設 geom_smooth() 的示例

在 geom_smooth() 中使用 GLM

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05)
   geom_smooth(method = 'glm')

使用 geom_smooth() 與預設 GLM（即 LM）的示例

在 geom_smooth() 中的 Poisson GLM

ggplot(data = dat, aes(x = dose, y = cells)) +
   geom_jitter(width = 0.05, height = 0.05) +
   geom_smooth(method = 'glm', method.args = list(family = 'poisson'))

Poisson 迴歸圖示例

步驟總結

繪製不重疊的點
加上 Poisson 趨勢線
美化圖表（此處略）

一起來練習吧！

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