視覺化 Logistic GAM

R 中的廣義加法模型（GAM）之非線性建模

Noam Ross

Senior Research Scientist, EcoHealth Alliance

尺度轉換

對數勝算圖

plot(binom_mod)

轉換部分效果

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

轉換部分效果（2）

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis)

加入截距

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

加入截距（2）

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1])

納入截距不確定性

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis,
     shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE)

優化繪圖

plot(binom_mod, pages = 1, trans = plogis, shift = coef(binom_mod)[1],
     seWithMean = TRUE, rug = FALSE, shade = TRUE, 
     shade.col = "lightgreen", col = "purple")

一起來練習吧！

R 中的廣義加法模型（GAM）之非線性建模