差異表現分析

使用 R 中的 limma 進行差異表達分析

John Blischak

Instructor

差異表現分析的目標是什麼？

• 找出與目標表型相關的基因
• 範例：
  • 對藥物等刺激的反應
  • 發育過程中的變化
  • 基因突變的影響

為什麼做差異表現？

• 新穎性

  • 是否還有其他值得關注的基因？

• 脈絡

  • 某基因的量測是獨特還是常見？

• 系統

  • 哪些生物途徑很重要？

完成實驗的多個步驟

• 設計研究
• 執行實驗
• 蒐集資料
• 前處理資料
• 探索資料
• 檢定資料
• 解讀結果
• 分享結果

注意事項

• 量測是相對值，不是絕對值

• 統計方法無法挽救設計不佳的研究

一起來練習吧！

使用 R 中的 limma 進行差異表達分析