用 pandas 表示網路資料

Python 網路分析進階

Eric Ma

Data Carpentry instructor and author of nxviz package

以 CSV 儲存網路資料

CSV 檔

person,party,weight
Barrett.Samuel,LondonEnemies,1
Barrett.Samuel,StAndrewsLodge,1
Marshall.Thomas,LondonEnemies,1
Eaton.Joseph,TeaParty,1
Bass.Henry,LondonEnemies,1

以 CSV 儲存網路資料

優點：
- 易讀（人類可讀）
- 可用 pandas 進一步分析
缺點：
- 重複、占用磁碟空間
兩個 DataFrame：節點清單與邊清單

節點清單與邊清單

節點清單
- 每列代表一個節點
- 欄位是該節點的中繼資料
邊清單
- 每列代表一條邊
- 欄位是該邊的中繼資料

Pandas 與圖形

list(G.nodes(data=True))

[(0, {'bipartite': 0}),
(1, {'bipartite': 0}),
(2, {'bipartite': 0}),
...]

nodelist = []

for n, d in G.nodes(data=True):
    node_data = dict() 
    node_data['node'] = n

    node_data.update(d)

    nodelist.append(node_data)

Pandas 與圖形

nodelist

[{'bipartite': 0, 'node': 0},
{'bipartite': 0, 'node': 1},
{'bipartite': 0, 'node': 2},
{'bipartite': 0, 'node': 3},
{'bipartite': 0, 'node': 4},...]

Pandas 與圖形

import pandas as pd
pd.DataFrame(nodelist)

  bipartite  node
0           0     0
1           0     1
2           0     2
3           0     3
4           0     4
5           1     5
6           1     6
7           1     7

pd.DataFrame(nodelist).to_csv('my_file.csv')

一起來練習吧！

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