ChIP-seq 複習

在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

Peter Humburg

Statistician, Macquarie University

複習：匯入資料

載入 peak 呼叫結果

peaks <- import.bed(peak_file, genome="hg19")

建立 BamViews 物件

bam_views <- BamViews(bam_file, bamRanges=peaks)

載入讀段

reads <- readGAlignments(bam_views)
在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

複習：視覺化 ChIP-seq 資料

在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

複習：差異性結合

在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

複習：富集分析

在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

持續精進

在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

做得好！

在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq

Preparing Video For Download...